El embalse de Salto Grande enfrenta una problemática ambiental que se ha vuelto cada vez más evidente: la proliferación de floraciones algales nocivas (FAN), un fenómeno impulsado por el exceso de nutrientes en el agua y condiciones climáticas favorables. Estas floraciones, dominadas en gran parte por cianobacterias, no solo alteran el equilibrio ecológico del ecosistema acuático, sino que también generan serias implicancias en la salud pública y en el uso recreativo del agua. Pero el deterioro del embalse de Salto Grande no es un destino inevitable. Con políticas adecuadas y una participación activa de la comunidad, es posible revertir el daño y garantizar la sostenibilidad de este recurso vital para la región.

El lago de Salto Grande enfrenta un creciente problema debido a la proliferación de algas que tiñen sus aguas de un tono verdoso. Estas floraciones, además de alterar la estética del paisaje, pueden ser tóxicas para animales y personas, representando un riesgo para la salud pública y afectando las actividades recreativas en la zona. Según informes recientes, las playas del lago se encuentran en Alerta 2 o "Rojo", lo que indica una alta concentración de algas y la recomendación de evitar el contacto con el agua. En busca de soluciones a este problema, países como España, Polonia y El Salvador, pero también provincias de la Argentina como Salta, han implementado tecnologías innovadoras para controlar la proliferación de algas. Una de ellas es el uso de boyas ultrasónicas. En 2016, en el Puerto de Federación se implementó un proyecto piloto que involucró la instalación de una boya equipada con tecnología de ultrasonido para monitorear y controlar la proliferación de cianobacterias en el Lago Salto Grande, pero no se conoció, al menos públicamente, información concluyente sobre los resultados obtenidos.

A partir de microorganismos, un proyecto interinstitucional de la UBA y AySA logró reducir a diario grandes proporciones de contaminantes de 12 mil litros de aguas residuales urbanas, y producir cerca de 1 kilo de insumo para biofertilizantes. Plantean replicar la experiencia en otros puntos del país.